动植物miRNA的区别

茎环结构

植物的更大、更复杂，预测的折回（fold-back）长度变异（64-303nt）比动物miRNA（60-70nt）明显。

miRNA长度

植物多为21nt，而动物miRNA长度多为22-23nt，这源于Drosha与DCL1切割性能的差异。

保守性

保守性均较高，但是植物相对于动物保守性更高。

miRNA末端碱基

植物miRNA 5’端优选尿嘧啶U，热力学分析表明：这种末端不稳态是通过RISC来维持的。

miRNA前体加工

植物miRNA前提由Dicer酶执行两步切割，在细胞核内形成互补双链，出核解旋后发挥功能：而动物miRNA的前提在核内由Drosha仅完成初步切割，产物以茎环结构形式转移到细胞质中，由Dicer酶完成第二步切割，形成互补双链形式。

靶基因的配对方式

植物miRNA与靶mRNA几乎完全互补配对，而大多数动物miRNA与其靶mRNA不是互补完全配对的。

靶基因结合位点

植物miRNA可以与靶mRNA的任何区域结合（主要是蛋白编码区），通过切割靶mRNA或抑制靶mRNA翻译实现对基因表达的调控，动物miRNA主要针对靶mRNA的3’非编码区域（3’UTR），作用机制为抑制翻译。