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转录组测序需要多大的测序量才能足够？
2024/1/19
转录组测序前，需要对物种转录组的大小进行评估，评估方法如下：
对于有参考基因组的物种，可以分析基因组信息，统计编码基因的个数，及其碱基数，从而估计物种转录组的大小，另外可以查询相关或相近物种转录组研究的文献，作为参考。对于无参考基因组的物种则只能参考相近物种的转录组大小。
转录组测序所需的测序量随研究目的的不同而有所差异。目前，为保证数据分析结果的可靠性和准确性，推荐转录组测序采用最低4Gb clean data进行后续分析，如果想检测到低丰度的转录本推荐采用10Gb 以上clean data。
攸归生物整理出常见物种推荐测序量表格，需要的老师可写邮件至service@orizymes.com索取。
对于有参考基因组的物种，可以分析基因组信息，统计编码基因的个数，及其碱基数，从而估计物种转录组的大小，另外可以查询相关或相近物种转录组研究的文献，作为参考。对于无参考基因组的物种则只能参考相近物种的转录组大小。
转录组测序所需的测序量随研究目的的不同而有所差异。目前，为保证数据分析结果的可靠性和准确性，推荐转录组测序采用最低4Gb clean data进行后续分析，如果想检测到低丰度的转录本推荐采用10Gb 以上clean data。
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