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是否需要生物学重复?重复几次?

2024/1/19

生物学重复的设置是实验设计中一个不可或缺的部分。设置生物学重复的目的主要包括如下两个:1通过重复样品的平均值得到更准确的测量结果;2计算样品群体的方差,从统计学方法上判断两组样品质检的差异是否具有显著性。在设计实验时如果没有生物学重复或者生物学重复数量不够,就不能得到有统计意义的实验结果,获得的差异表达基因很可能仅仅是少数个体差异的表现,而不能反映群体的本质特征。所以实验中设计合理数量的生物学重复是非常重要的。

早期基于高通量测序的组学研究,可以不设置生物学重复,或通过将若干生物学重复混合为一个样本后测序的策略,来部分弥补个体差异的影响(如 BMC genomics等SCI期刊上的相关研究普遍采取这个策略)。随着测序价格不断下降,对多个生物重复样本的单独进行测序也逐渐成为高通量测序项目的趋势。2011年7月Hansen发表的文章表明生物学差异是基因自身表达的特性,与检测技术的选择以及数据处理的方式无关。如果不设生物学重复,高影响因子的杂志可能会因此而拒稿。

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