色氨酸是一种人体必须氨基酸，且不可以自身合成，需要从外界食物中获取。色氨酸除了合成组织蛋白质，色氨酸还是血清素（血清素代谢途径，Serotonin Pathway）的前体，血清素是一种重要的神经递质；也是犬尿氨酸（犬尿氨酸代谢途径，Kynurenine Pathway）的前体，生成烟酸、CO2、犬尿喹啉和黄尿酸；在肠道微生物的作用下色氨酸分解代谢为吲哚、吲哚丙酸、吲哚乳酸、吲哚乙酸等物质（芳香烃受体代谢途径，AhR Pathway）。色氨酸代谢具有重要的功能，包括调节情绪行为、免疫反应、生长发育、可以作为肿瘤、自身免疫病和神经系统疾病等多种疾病的治疗靶点。